Phần 1 và 2: Cuộc Chạy Đua Với Thời Gian.

Thành phố Tokyo vào năm X012 khi con người đang phải đối mặt với thảm cảnh mang tên thí nghiệm ( viết tắt TN). Thời điểm này hai bên chia làm hai phe và bọn thí nghiệm lên nắm quyền. Chúng bắt con người phải phục tùng chúng, làm nô lệ cho chúng và giúp chúng sản sinh ra thêm những đứa con thí nghiệm quái dị khác để cùng nhau thống trị thế giới.
Vào lúc bấy giờ, con người vì không chịu đựng được trước sự xâm chiếm của thí nghiệm nên đã thành lập một trung tâm lớn tên là A. Nơi đây luôn chào đón những người sẵn sàng đủ dũng cảm để chiến đấu trong nguy hiểm và phải đem cả tính mạng ra để đặt cược.
Những con người gan dạ, liệu họ có thể lấy lại sự bình yên? Thí nghiệm hay họ là những kẻ còn tồn tại trên thế giới này?
P1: Một cậu bé tên Kazuo từng sống ở trại trẻ mồ côi. Cuộc sống khá yên bình và nhạt nhẽo. Cậu là một đứa trẻ thích ở một mình và muốn tự cô lập với những người xung quanh. Có một lần cậu vô tình rơi vào tầm ngắm của bọn khoa học xấu xa, chuyên chế tạo ra thí nghiệm và cuộc đời cậu bắt đầu rơi vào hố sâu với nhiều cạm bẫy nguy hiểm xung quanh.
P2: Sau khi thí nghiệm 626 đánh bại được Đại Vương Kisame. Cậu đã thay thế chức vụ của hắn. Trung tâm thí nghiệm tồn tại rất vững vàng sau vài năm yên bình. Nhưng rồi một vụ mất tích của thí nghiệm nước và thí nghiệm cây xảy ra khiến cho Nữ hoàng Toyama phải đích thân đến gặp cậu. Những nguy hiểm lần lượt kéo đến, bắt đầu là khi rơi vào thế giới khác.